遗传学研究表明，狗从狼进化而来，与狼非常相似，就像人与人之间生理特征的差异一样。换句话说，差别不大。“即使是最容易改变的线粒体DNA标记，也就是遗传自母亲的DNA，狗和狼之间的差异也不会超过1%。”加州大学洛杉矶分校的遗传学家罗伯特·韦恩说。
韦恩说，像狼这样的物种起源于100到200万年。韦恩在遗传学领域的研究表明，有一种动物是狗，大约在100万年内与狼分道扬镳。科学家们在400万年初的人类化石周围发现了狼的化石；但人狗同时出土的化石只有1.4万年。这些研究表明，早在农业发展和人类定居之前，狼和狼就开始定居在一个地方／或者狗已经和人类或人类的祖先在一起。当时，人类和狼／狗靠捕猎和吃腐食维生。
本该良性竞争的人和狼／狗，为什么要携手合作？答案可能是这样的：狼与早期人类氏族社会的结构和规模非常相似，双方的目标和范围兼容，人类愿意接受年轻或更不威胁的狼。
在黑暗中，狼可以在危险接近时用敏感的感官报警。
抽象理论家猜测，一些狼或原始狗因为闻到食物的香味而试图挤进早期人类的篝火，进一步证明他们没有攻击性或可以成为一个好的助手，并能够进入早期人类的聚集地。25或30只狼和数量相近的游牧祖先一个接一个地走过荒野，猎杀大型猎食。狼在基地周围徘徊，捡起残羹剩饭，而人类可能会利用狼出色的嗅觉和速度来寻找和跟踪可能的猎食。在黑暗中，狼也可以在危险接近时用敏感的感官报警。
当时的生活可能并不像我们想象的那么艰难。大多数时候，食物相当丰富，很少捕食动物，人类和野生动物之间的障碍也不乏差距。
正是通过这些差距，小或不威胁的狼慢慢占据了我们的心。这些狼过着由领导控制的群居生活，精通伏低做小的技巧，所以适应了被人类主宰的日子。小狗特别可爱，就像现在一样。因此，人与狗之间的联盟关系诞生了，饲养的历史也进行了。
自从狗被饲养以来，它们如何在相对较短的时间内进化出这么多不同形状的品种，从一只吉娃娃到两个大男人都抱不住的长毛藏獒？如果人的体型差别这么大，那就意味着最矮的人只有10公斤重，最高的人有一公吨。这种狗是怎么来的？
分子遗传学家和狗育种协会的遗传研究主持人杰夫·桑普森认为，由于狗有78种染色体，远远超过46种人类，混合和匹配的机会相对增加，而混乱的鸳鸯谱是人类。“这么多品种不是演变而来的，而是育种者选择某些特征培养的结果。在过去的三四百年里，人类选择了他们最喜欢的特征，很快就成功地培养出来了。”桑普森说。
他进一步表明了他的朋友布鲁斯·卡塔纳克的研究。布鲁斯也是一名遗传学家，研究老鼠是他的工作，他对带拳击展示感兴趣。桑普森说：“每个人都认为拳击手的狗应该剪掉尾巴，但现在兽医不喜欢做这种美容手术，所以他决定培养没有尾巴的拳击手的狗。”
这只狗有78个染色体
没过多久他就成功了。为了实现这一愿望，布鲁斯将拳师狗与天生没有尾巴的韦尔斯柯基狗交配，然后选择最像拳师狗但没有尾巴的后代与其他拳师狗交配。八年四代后，他培养了一只天生没有尾巴的拳师狗，在狗展上大放异彩。
人类选择一些大狗看门，跑得快帮忙打猎，而小狗则作为伴侣。
布鲁斯说:“狗的体型差别很大，可以说是各种物种中最大的。人类从一开始就故意选择一些类型的狗:大的用来看门，跑得快的用来帮忙打猎，小的用来玩赏犬做伴。用基本的贵宾狗培养玩具贵宾狗很简单。但是我从来没有发现其他物种会让人想画葫芦。我相信老鼠不能这样做。狗是狼驯化的。早在狩猎采集时代，人们就把狗养成了狩猎的助手。因此，狗是人类最早饲养的牲畜。河北武安磁山、河南新郑裴李刚、浙江余姚河姆渡等遗址，都发现了狗骨，证明了其悠久的饲养历史。
山东胶县三里河出土的狗形生动逼真，让我们看到了新石器时代家犬的形态特征。陕西西安半坡遗址出土的狗骨头小，额骨突出，肉裂牙小，下颌水平边缘弯曲，与华北狼有很大不同，说明人类养狗的历史确实很早。
1、犬类祖先
没有人准确地知道人和狼之间的第一次互动是什么时候发生的。一些科学家认为，这可能是在5万年前，因为狼至少需要这么长时间才能发展出今天的基因差异。当时，人和狼分布在地球表面的许多地方，演变可能发生在几个不同的地区。
一些学者认为，狼在14000年前，甚至在16000年前的亚洲东南部，已经被人类从野生狼驯化为牲畜，即狗，用于玩耍、狩猎和看家。目前，世界上所有类型的狗都起源于在中国长江流域南部饲养了大约1.6百万年的狼。（瑞典皇家理工学校科学家彼得·萨弗莱宁确定了狗的起源和时间） 。
二、驯化过程
狗的生物学起源可以追溯到几千万年前。狗的驯化史大约在1.5万年前的中石器时代。一些科学家甚至从遗传学的角度证明，狗可能早在100万年前就被人类驯化了。
人类第一次破解狗的基因组是在2005年，甚至比研究人员使用遗传工具来跟踪狗最早的家。最初的研究在东亚发现了狗基因的高度多样性，并在许多农村犬群中发现了其他关键的标记，因此指出东亚是人类最早饲养狗的地方。
亚利桑那大学的研究人员从比利时和西伯利亚出土了至少3.3百万年的两只狗的颅骨，表明这只狗早在古代就被人类驯服了。
三、基因密码
在过去 1.4 一万年来，经过不断的驯化，生产了400多种狗。每一种都有独特的体格、基本的颜色和习惯。2009年，为了发现导致狗特定特征的基因变异 年 Akey等阐述 10 个品种共 275 第一只狗的基因组。之前的研究发现，具有特定特征的基因，如达克斯狗的短腿。
他们阐述了一系列品种的狗，然后确定了几个世纪的选择性繁殖对整个狗基因组的影响。这组作者扫描了几乎近一组作者 300 头犬的遗传记录包括小猎犬、博德牧羊犬和杰克罗素 狗、沙皮狗和标准女士狗决定了选择性繁殖如何影响这些动物基因组。
作者发现了155 不同的遗传位置可能在纯种犬的特征中发挥作用，并提出这些数据可能为找到具体类型和形状的基因提供线索。例如，这组科学家提出了不同的版本 HAS2 基因可能会给沙皮狗带来独特的褶皱或光滑的皮肤。与犬类外观特征的研究相比，生理特征的研究较少。
2012 年 Chen 对犬狼嗅觉受体基因家族进行分类和测序分析，发现犬狼嗅觉受体基因进化方向不一致，我国农村犬嗅觉受体基因序列相对保守。
Lindblad-Toh和Erik Axelsson对来自世界各地的12只狼和代表14个不同品种的60只狗进行了全基因组测序。研究小组最终提出了一个共有122个基因的名单，包括36个区域。其中一半包括脑基因。其中6个区域，10个基因与脂肪和淀粉消化有关。
具体来说，狗携带额外复制的淀粉酶基因，现在比狼多28倍。此外，狗产生的麦芽糖酶-葡萄糖淀粉酶需要12倍，因为酶基因有多个突变。第三个基因SGLT1突变改善了肠道糖吸收蛋白质的功能。这表明淀粉消化与狗的进化有关。